ジム・ゴードンを更迭し、マフィアの傀儡がゴッサム市警に居座る。一方で魔術を駆使する悪がゴッサム水面下でうごめく。一見バラバラに思われたこれらの出来事には、遠大な陰謀が隠されていた。すべてはバットマン―ブルース・ウェインをおとしめるために…。ゴッサム中のヴィランたちが、彼らすらも恐れおののく謎の人物の下に集結する中、バットマン、そしてバットファミリーたちは、ゴッサムを救うことができるのか？