ゲームで大人気の“ツムツム”が、マーベル・コミックスに登場！コレクターの元へ届けられるはずだったコンテナが、輸送の途中で宇宙から地球に落下してしまう。拾ったのは、ブルックリンに暮らす３人のティーンエイジャーたち。コンテナを開けてみると、なかにはかわいい謎の生き物“ツムツム”が入っていた。なんと彼らは、ヒーローの能力をコピーすることができるのだ！しかしそれは、ヴィランの能力をもコピーできるということだった…。ツムたちの力を借りて、少年たちはウルトロンとの戦いを生き抜くことができるのか？