巨大嵐が世界を引き裂きそうになった事件の謎を追究したソーは、生ける惑星“エゴ”が太陽系を突っ切っていったことをつきとめる。“エゴ”は謎の長命宇宙人コレクターに囚われた弟を救おうと急いでいたのだ。だが、兄弟の邂逅は不幸を呼んだだけだった。“エゴ”と弟星“オルターエゴ”が出会えば、一つの星しか生き残れない。つまり、もう一つの惑星は滅びる運命なのだ。その運命を避けられるパワーを持つのは雷神ソーのみ。しかし、そのためには昔の恋人をはじめ、過去の因縁に向き合わねばならなかった…。